Hola Barros
En virtud de mi humilde experiencia:
como poderse hacer, se puede hacer un sólo proyecto compuesto por CT + Red de Distribucion en BT, pero es recomendable hacerlos por separado:
por un lado el entronque con la red de MT + CT
y por otro la red de BT
¿y por que?
Porque van a llevar caminos separados en Industria, ya que "normalmente" el primero requerira autorización administrativa previa a su ejecución(no quiero entrar en más detalles

), y el segundo se tramita por el proceso "20 días"(

nunca tardan "tan poco"

), por lo que es más comodo iniciar el expediente de MT y un poco más adelante el de BT

.
Además, el proyecto de red de BT recomiendo que sea sólo eso, red de BT, y no incluir la instalación interior de las naves.
¿y por qué?
Porque al ser la red de distribución en BT(esto es que queda abierta al uso de terceros) la misma pasará a ser propiedad de la compañía distribuidora correspondiente(mediante el cambio de titularidad), por lo que es mejor independizar los trámites.
Espero haberte aclarado un poco las dudas