Buf, la consulta es tan genérica y global, que casi es un barrido de contenidos de todos los foros...
Para lo relativo a temas fiscales y demás, échale un ojo a
viewtopic.php?f=6&t=2611En cuanto al tema técnico, no queda claro si es un almacén que ya estaba desarrollando su actividad "en plan pirata" y ahora les han pedido que regularicen o "legalicen" su situación, o si la actividad aún no se está llevando a cabo y tú la vas a proyectar.
Tendrás que obtener las autorizaciones o licencias correspondientes, desde el Ayuntamiento en cuanto a la actividad, desde Industria en cuanto a las instalaciones que así lo requieran, y desde la Consejería de Medio Ambiente de tu comunidad en cuanto a la gestión de los residuos. Los contenidos para el proyecto lo marcará la normativa aplicable, a tenor de lo anterior.
Sé que todo es muy genérico, espero que al menos te dé una cierta visión de cómo plantearlo.