Todo depende de tus preferencias.
Ambos Máster son muy parecidos, aunque el de ICAI tiene mas horas de formación relacionada con redes electricas, economia y finanzas.
Además una gran parte se imparte en ingles, por lo que debes tener un buen nivel. Eso si, cuando acabes tendrás trabajo seguro.
El de tecnatom, yo lo veo más completo ya que tiene bastantes más horas de carga lectiva. Se centra más en el mantenimiento y operacion de centrales. Solo el módulo de nucleares se imparte en ingles, pero todavia no es seguro (según me han informado).
Que sea oficial o no me parece una tontería (bueno la única diferencia es que para el oficial puedes pedir beca y para el propio no). Si quieres hacer un doctorado

haz un master oficial. Pero no creo que hagas este máster con el objetivo de hacer un doctorado.
De hecho, por definición, los másteres propios tienen orientación profesional y los oficiales tienen orientación científica.
Si acabas decidiéndote por el de Tecnatom, nos conoceremos en clase, yo ya estoy admitido.