Para calentar agua se quiere una energía que es:
Q (kcal) = Volumen (litros) . (t2-t1)
y según Joule 1 cal=4,18 Julios; en un segundo son Watios.
Los watios son = V.I
Es decir, el rendimiento de la conversión de electricidad a calor con una resistencia eléctrica es = 1
Con un microondas seguramente aparecen pérdidas por refrigeración del equipo, calentamiento de componentes electrónicos, fugas de microondas, etc..
O sea que es más eficiente calentar el agua con una resistencia eléctrica de inmersión, y además seguramente será más rápido que con las microondas (mira los calentadores instantáneos eléctricos).
Saludos.